Wnioski o przyznanie stypendium Prezesa Rady Ministrów przedstawia się radzie szkoły, a jeżeli rada szkoły nie została powołana - radzie pedagogicznej, w terminie do dnia 20 czerwca roku szkolnego poprzedzającego rok szkolny, w którym ma być przyznane stypendium.

Rada szkoły, a jeżeli rada szkoły nie została powołana - rada pedagogiczna, po wnikliwym przeanalizowaniu kryteriów określonych w art. 90 h ust. 2 ustawy o systemie oświaty zatwierdza jednego kandydata do stypendium.

Wniosek o przyznanie stypendium Prezesa Rady Ministrów, zatwierdzony odpowiednio przez radę szkoły albo radę pedagogiczną, dyrektor szkoły przedstawia kuratorowi oświaty w terminie do dnia 4 lipca br. (sugerowany termin przez Kuratorium Oświaty w Gdańsku).

Kurator oświaty sprawdza zgodność wniosków z warunkami określonymi w art. 90 h ust. 1-3 ustawy, sporządza listę zbiorczą zatwierdzonych kandydatów do stypendium i przedstawia ją za - pośrednictwem ministra właściwego do spraw oświaty i wychowania - Prezesowi Rady Ministrów w terminie do dnia 31 lipca roku szkolnego poprzedzającego rok szkolny, w którym ma być przyznane stypendium.

Stypendium Prezesa Rady Ministrów wypłaca się w dwóch ratach:
- pierwsza rata - do dnia 30 listopada, za okres od września do grudnia;
- druga rata - do dnia 30 kwietnia, za okres od stycznia do czerwca.

Stypendium Prezesa Rady Ministrów wypłaca się na rachunek bankowy ucznia lub jego rodziców.
Na wniosek ucznia lub jego rodziców stypendium jest wypłacane w inny sposób.